أنشئت كلية الهندسة مع إنشاء جامعة الطفيلة التقنية بتاريخ 17/1/2005 بثلاثة أقسام أكاديمية هي قسم الهندسة الكهربائية وقسم الهندسة الميكانيكية وقسم هندسة الموارد الطبيعية والكيميائية  وقد شهدت الكلية تطوراً سريعاً منذ ذلك التاريخ بحيث أصبح فيها حتى تاريخه أربعة أقسام أكاديمية بعد استحداث قسم الهندسة المدنية وعشرة تخصصات موزعه على الأقسام الأربع.
وتضم كلية الهندسة (43) عضو هيئة تدريس من حملة الدكتوراه والماجستير وعدد الطلبة فيها يصل إلى
(1000) طالب وطالبة في مختلف التخصصات. ومن المأمول أن يتم استحداث تخصصات جديدة في هندسة العمارة والهندسة الصناعية في المستقبل القريب كما ويتوقع زيادة في أعداد الطلبة خلال الأعوام الخمسة القادمة ليصل إلى
(3500) طالب وطالبة هذا بالإضافة إلى زيادة ملائمة من أعضاء هيئة التدريس من خلال التعيين والابتعاث.
ومن الجدير بالذكر أن جامعة الطفيلة التقنية قد رشحت للابتعاث للحصول على درجة الماجستير والدكتوراه ما يزيد على ( 40 ) مرشح في مختلف تخصصات كلية الهندسة هذا بالإضافة إلى تميز وتفرد التخصصات الهندسية في الكلية مثل: هندسة ميكانيك السيارات وهندسة التعدين والهندسة الجيولوجية.