بـدأت دائـرة شـؤون العـاملين كشعبـة منـذ تـأسيس الجامعـة وتحولـت الـى دائـرة مـع بدايـة الفصـل الثانـي 2005/2006.                                       
وتقـوم دائـرة شـؤون العـاملين بتسهيـل خدمـة العـاملين فـي الجامعة من أعضـاء الهيئـة التدريسيـة والاداريـة والمستخدميـن وفقـاً لرؤيـة جامعـة الطفيلـة التقنيـة بحيـث تساهـم فـي ايجـاد بيئـة اداريـة وابداعيـة وفـق قاعـدة بيانـات تشمـل علـى كـل المعلومـات الاساسيـة المتعلقـة بالعـاملين فـي الجامعـة مـن خـلال تنظيـم العـمل ليتجـاوب مـع حاجـات العـاملين بدرجـة عاليـة مـن الكفـاءة والفاعليـة والمساءلـة والعـدالـة.
وتنقسم الدائرة الى ثلاث شعب وهي :

1-شعبة اعضاء الهيئة التدريسية:
وتتلخص مهامها في تنفيذ قرارات تعيين وتحديد الراتب ومتابعة حركات الهيئة التدريسية داخل الجامعة من حيث الزيادة السنوية والترفيع والنقـل والتثبيت والعـلاوات وغيرها.
2-شعبة الإداريين والمستخدمين:
وتتلخص مهامها في تنفيذ قرارات التعين تعيين وتحديد الراتب ومتابعة حركات الموظفين من حيث الترفيع والنقل والتصنيف والتثبيت والعلاوات بانواعها والزيادة السنوية وترصيد الاجازات والمغادرات وغيرها.
3-شعبة التأمين الطبي:
وتتولى إدارة التأمين الصحي من اشتراك و إصدار بطاقات المعالجة ومتـابـعـة اتفاقيات التـأمين الصـحي و اسـتـلام المطـالبـات المـاليـة وانجازها.